计算机软件新技术国家重点实验室是在南京大学计算机科学与技术系和计算机软件研究所多年进行软件研究的基础上于1986年底通过专家论证，1987年开始筹建，1990年建成，并通过国家验收，被批准向国内外开放。1993年通过第一次评估，1997年通过第二次评估，2002年通过第三次评估，2007 年3月通过第四次评估，并被评为信息科学领域优秀类国家重点实验室，2012年3月通过第五次评估，再次被评为信息科学领域优秀类国家重点实验室。现任实验室主任中国科学院院士吕建教授，学术委员会主任中国科学院院士杨芙清教授。
实验室定位于应用基础研究，旨在利用软件新技术快速发展给我们带来的挑战与机遇，结合国家在信息化建设方面的重大需求，以探索计算机软件领域面临的重大科学问题为导向，以软件新技术领域的基础性与共性问题为切入点，坚持“研究力求原创，技术取得突破，成果促进产业”的指导思想，在计算机软件新技术研究与应用、以及***人才培养方面形成特色和优势，为促进中国软件产业的又好又快发展做出贡献。
实验室的主要研究方向是：新型程序设计与软件方法学、软件质量保障与自动化技术、分布计算与系统安全技术、机器学习与智能化信息处理技术、媒体计算与内容处理技术。具体而言，主要研究内容可从宏观上凝练为“一个体系、两个切入点、三个层次和四项重点任务”。一个体系：面向Internet的软件方法学与技术支撑体系;两个切入点：软件方法学与机器学习;三个层次：开放化与网构化的软件方法学，智能化和可信化的关键支撑技术，以及普适化和自然化的基本应用模式;四项重点任务：网构化与可信化的软件方法学框架，机器学习与智能化软件支撑技术，普适化的分布式应用支撑技术，人本化的媒体内容处理技术及其应用。
